В мире, где Япония постоянно подвергается нашествию гигантских чудовищ, известных как кайдзю, разрушающих города и сеющих хаос, человечество создало специальные Силы обороны. Эти элитные бойцы, обученные противостоять монстрам, ставят свою жизнь на кон ради защиты мирных жителей.
Кафка Хибино, 32-летний мужчина, с детства мечтал стать одним из них. Однако, несмотря на все его старания, судьба распорядилась иначе. Не сумев пройти вступительные экзамены, Кафка устроился в специальную службу, занимающуюся уборкой последствий битв с кайдзю. Эта работа, хоть и опасная, требует не меньшей отдачи и самопожертвования.
Однажды, в ходе очередной миссии по очистке разрушенного города, жизнь Кафки кардинально изменилась. Он столкнулся с необычным существом, напоминающим паразита, который проник в его тело. Этот инцидент открыл перед ним новые возможности и угрозы, перевернув его мир с ног на голову.