В мультсериале "Класс убийц" раскрывается история о загадочном и чрезвычайно опасном существе, которое разрушило большую часть Луны и грозится сделать то же самое с Землей, если его не удастся уничтожить. Эту игру с судьбой мира придумал странный пришелец по имени Коро-сэнсэй, который с радостью уничтожает планеты. Мировой конгресс, собранный в спешке, оказался бессильным перед этой угрозой. Теперь вся надежда возлагается на японских школьников, так как их учитель из особого класса 3-E является тем самым монстром.
Ученики класса 3-E, состоящие из лодырей, двоечников и прогульщиков, неожиданно оказываются в роли защитников Земли. Они могут использовать любые средства для достижения своей цели, но вопрос в том, что может уничтожить этого монстра, который физически и по способностям превосходит людей во много раз. Он движется с невероятной скоростью, как молния, и его щупальца могут мгновенно усмирить любого, кто осмелится напасть на него. Таким образом, школьникам предстоит придумать что-то действительно разрушительное, чтобы победить этого негодяя.
Для решения этой непростой задачи школьникам придется напрячь свои не очень умные головы и объединить усилия. В процессе обучения и подготовки они не только учатся боевым навыкам и стратегиям, но и развивают свои интеллектуальные способности, чтобы найти слабое место монстра. "Класс убийц" становится не просто школой для убийц, но и местом, где формируются настоящие герои, готовые защитить мир от угрозы уничтожения.
